美空军史上最成功的斩首行动，但行动须征得随军牧师的同意

因成功策划珍珠港事件，山本五十六被日本称为“海军之神”。美国人却恨他入骨，誓要为珍珠港死难士兵复仇。

1942年底至1943年初，两艘日本潜艇相继在西太平洋触礁沉没，美国潜艇闻风而动，迅速找到了那两艘沉没的潜艇，并从上面获得了大量绝密电报文件。这些文件随后被送往美国海军情报部进行破译。

1943年4月14日深夜，一位美军情报人员惊喜地喊着“这个情报太重要了”。原来这份情报显示“山本五十六于4月18日上午8点45分视察肖特兰基地”，只是还无法确定这份密电的可靠性。

在发现这份电报的前一天下午，美国海军情报部也截获了日军一份内容很长的密码电报，情报人员们正在努力破译。三天后，他们终于破译了该份密码电报，内容竟然和在潜艇上找到的电报内容一样，只是更加详细与准确。这表明日军密码电报是真的。

这份电报被辗转送到美国罗斯福总统的案头，在罗斯福做出击杀决定之前，还发生了一段小插曲。

按照西方传统的军事伦理来看，在战争中伏击对方统帅被认为是一种极卑劣的行径，不是骑士的风格。对于究竟要不要批准伏击山本五十六的行动，罗斯福犯了难。

这时，美国海军舰队总司令金海军上将指出，山本五十六要去的地方是前线，在作战区域内，一名海军大将和一名普通的士兵是一样的，他们都是合法的射击目标。何况山本五十六还是毫无信用发动偷袭珍珠港的元凶，早已失去了国际法的保护，即便他活到战争结束，也要接受军事法庭的审判。随后，海军部长诺克斯在征求了随军主教关于截杀敌方统帅并不违背道德并获得同意之后。

罗斯福最终亲自作出了出击决定。

4月18日黎明，天空晴朗，执行复仇行动的飞行员被再次命令不惜一切代价歼灭山本五十六座机。

战斗空中编队关闭了所有无线电台，只靠罗盘和速度表导航，以超低空（不到10米）飞行。在飞行了960千米后，比山本五十六的座机提前50秒到达预定劫击空域。

在激烈的缠斗中，山本五十六座机右引擎、机翼中弹，爆炸起火，座机两翼折断，坠毁于离卡伊里湾几千米的丛林中。

第二天，日军找到了山本五十六飞机的残骸，他们发现山本五十六头部中弹而亡，死时手握军刀，眼睛是睁着的。日本当局直到5月21日才宣布“山本五十六壮烈牺牲”的消息。

由于美国的保密工作做得好，在战争结束前，日本人一直认为山本五十六的死是一次意外。